Bitno je napomenuti da se za prve korake u MATLAB-u korektnom analizom poruke greške iz komandnog prozora može brže napredovati u radu. Tako je npr. poruka pri grešci koju smo već sreli bila:
>> y=average(x) ??? Undefined function or variable 'average'.Ovu je bila poruka nakon starta funkcije average kada nije bila u pathu. MATLAB javlja da nije našao ni funkciju ni varijablu imena average. Naime MATLAB nakon unosa određene naredbe (bilo u komandnom prozoru ili programu) ima u osnovi sljedeća pravila prioriteta3.4:
>> y=average(x) ??? Undefined function or variable 'sm'. Error in ==> C:\MATLAB6p5\work\average.m On line 10 ==> a = sm(b)/length(b); % izracun srednje vrijednosti
Pored ove greške nekorektnih imena varijabli (često s razlikom u velikom/malom slovu) najčešća je greška operacije na matricama nekorektnih dimenzija te sintaksna greška u zapisu matematičkih izraza i to kada se ispusti zagrada kao npr.:
>> y=average(x) ??? Error: File: C:\MATLAB6p5\work\average.m Line: 10 Column: 20 ")" expected, ";" found.
U MATLAB-u postoje alati za upravljanje greškama - prekidima programa kojima je moguće provjeriti uvjete zbog kojih je došlo do određene greške te ovisno o situaciji primijeniti odgovarajući algoritam (npr. try-catch petlja). Pored toga MATLAB ima ugrađen debuger kojim se može analizirati sama greška ili upozorenje kao i uvjeti zbog kojih je do njih došlo.